通過(guò)物理和化學(xué)的綜合作用使廢水得到凈化，主要有混凝法、吸附法、氣浮法、電解法和膜分離法等。混凝法通過(guò)投加化學(xué)藥劑，使其產(chǎn)生吸附、中和微粒間電荷、壓縮擴(kuò)散雙電層而產(chǎn)生的凝聚作用。破壞了廢水中膠體的穩(wěn)定性，使膠體微粒相互聚合、集結(jié)，在重力作用下沉淀.并予以分離除去。制藥廢水處理中常用的混凝劑有聚合硫酸鐵、聚合氯化鋁、聚丙烯酰胺等，該法會(huì)產(chǎn)生大量的化學(xué)污泥，造成二次污染，出水的pH較低，含鹽量高，且氨氮的去除率較低，因此常作為制藥廢水的預(yù)處理。

氣浮法利用高度分散的微小氣泡作為載體，黏附廢水中的污染物，由于黏附有污染物的微小氣泡密度小于水而上浮到水面，從而實(shí)現(xiàn)處理廢水的目的。該法具有少、能耗低、工藝簡(jiǎn)單、維修方便等優(yōu)點(diǎn)，但不能有效地去除可溶性有機(jī)物。常用來(lái)處理、、等懸浮物含量較高的制藥廢水。

電解法借助外加電流的作用，產(chǎn)生一系列化學(xué)反應(yīng)，使廢水中的有害雜質(zhì)以轉(zhuǎn)化的形式而被去除。它是通過(guò)兩極產(chǎn)生的新生態(tài)的氧和新生態(tài)的氫使廢水中污染物得到凈化。新生態(tài)的氧對(duì)水中有枷化合物和無(wú)機(jī)化合物進(jìn)行氧化，新生態(tài)的氫將處=互化態(tài)的某些色素還原成無(wú)色物質(zhì).達(dá)到較高的月生效果。

廢水電解處理包括電極表面電化學(xué)作角、間接氧化、間接還原、電浮選和電絮凝等過(guò)程。它們分別以不同的作用去除廢水中的污染物。膜分離法是個(gè)物理過(guò)程，有過(guò)濾和濃縮的作用，能處理高濃度、生化性差或傳統(tǒng)方法難以處理的制藥廢水，且COD的高低對(duì)處理效果影響不大。膜分離法具有設(shè)備簡(jiǎn)單、操作方便、無(wú)相變及化學(xué)變化、處理效率高和節(jié)約能源等優(yōu)點(diǎn)，但還存在膜組件價(jià)格高與膜污染等問(wèn)題。